曾国藩务饬各营预为布置，以防轰扑。并着李鸿章于沪上及沿江隘口，严密搜查，毋令洋人卖给粤匪枪炮，以断该逆接济。

逆首毕萃金陵，苏、常等处，贼势必单，李鸿章正可乘机克复苏、常，为步步进逼之计。

金陵贼势穷蹙，官军攻剿吃紧之际，该逆困兽犹斗，势必拚死抵拒。

曾国荃所奏，旬日间战守各情，诸军将士皆能奋勇倍加，喋血苦战。曾国荃现在调集江浦、浦口之萧庆衍七营过江，驻扎七瓮桥河边，扼守秣陵关小河进城之路，并以金陵城，尚须添募万人，以翼合围，克期扫荡。惟江浦、浦口等处防兵，亦不可过于单弱，着曾国藩与曾国荃妥筹，相机办理，仍须谋出万全，以期必胜。

八月一日，李鸿章攻克江阴。太平军忠王李秀成带大军救援苏州，金陵空虚。

慈禧太后指示：着曾国藩督饬曾国荃乘机进捣。

金陵城东还有数处关隘没有攻下：近城的是中和桥、双桥门、七壅桥，稍远的是方山土山、上方门、高桥门，迤南的是秣陵关等地。曾国荃下令猛攻，并派将夺取东路关隘。太平军真的拿出了秘密武器：洋枪队数千人，疯狂扫射，激战几昼夜。

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曾国藩上书： 金陵一城，面面布置，据有重险，为洪逆坚不可拔之基。自克九伏洲、江东桥数隘，而西南一面已为我有。兹又克七瓮桥、秣陵关等隘，而东南一面又为我有。现令萧庆衍进扎孝陵卫，经营城北，渐成合围之局。

慈禧太后大喜，多日一直悬着的心，终于可以放下来了。但是，她是一位冷静的女人，她的眼光总是放在未来：平定金陵之后，如何奖赏、安置曾氏兄弟和这些汉人精英？庞大的湘军、淮军是保留还是裁撤？要不要将曾氏诸将召来北京？朝廷大臣们敬佩曾氏诸人，但他们为何千方百计阻止他们入京？

慈禧太后笑了笑：这个曾剃头，一定要好好见见，城破之后，召他们进京。

十月二十五日，李鸿章克复苏州省城。十一月初五日，曾国荃面对固若金汤的金陵城，下令挖地道攻城。

十二月一日，慈禧太后降谕：现在金陵业经合围，着曾国藩饬令曾国荃密集围攻，断不可令忠逆（李秀成）乘隙他窜。

曾国藩兄弟依旧在作充分准备，步步为营，稳扎稳打。

同治三年一月二十一日，曾国荃攻克天保城，驻兵太平门、神策门。这样，金陵城已经完全合围。

六月十六日，在逐一削平金陵城外围的所有太平军重要据点之后，曾国藩命令曾国荃，开始正式进攻金陵城，取得空前大捷。六月二十七日，天王洪秀全服毒自尽。太平军拥立洪福 为幼主。曾国荃就使用地道战进攻：挖掘30余处地道，曾国荃亲自来到地道口指挥埋药，数次拼死争夺，最后终于引爆。霹雳一声，火光冲天，烟尘蔽日，瓦石土块漫天如雨。